Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
KNDC1Q76NI1 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
KNDC1Q76NI1 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
KNDC1Q76NI1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KNDC1Q76NI1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KNDC1Q76NI1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KNDC1Q76NI1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
KNDC1Q76NI1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
KNDC1Q76NI1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
KNDC1Q76NI1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
KNDC1Q76NI1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC36.38■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.33■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
KNDC1Q76NI1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
KNDC1Q76NI1 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
KNDC1Q76NI1 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
KNDC1Q76NI1 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
KNDC1Q76NI1 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
KNDC1Q76NI1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
KNDC1Q76NI1 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KNDC1Q76NI1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
KNDC1Q76NI1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KNDC1Q76NI1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KNDC1Q76NI1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.15■■■■□ 3.38
KNDC1Q76NI1 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
KNDC1Q76NI1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
KNDC1Q76NI1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.11■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36.1■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
KNDC1Q76NI1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms