Protein–RNA interactions for Protein: Q76KF0

Sema6d, Semaphorin-6D, mousemouse

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6dQ76KF0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sema6dQ76KF0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Sema6dQ76KF0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sema6dQ76KF0 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sema6dQ76KF0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Sema6dQ76KF0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6dQ76KF0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6dQ76KF0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6dQ76KF0 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sema6dQ76KF0 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6dQ76KF0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6dQ76KF0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6dQ76KF0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6dQ76KF0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sema6dQ76KF0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.5 ms