Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

Predictions only

Length 1,123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
USP43Q70EL4 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
USP43Q70EL4 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
USP43Q70EL4 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
USP43Q70EL4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP43Q70EL4 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
USP43Q70EL4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP43Q70EL4 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP43Q70EL4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP43Q70EL4 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
USP43Q70EL4 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP43Q70EL4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP43Q70EL4 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
USP43Q70EL4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms