Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW31

SYDE1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 735 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYDE1Q6ZW31 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SYDE1Q6ZW31 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SYDE1Q6ZW31 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE1Q6ZW31 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE1Q6ZW31 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
SYDE1Q6ZW31 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYDE1Q6ZW31 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYDE1Q6ZW31 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SYDE1Q6ZW31 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SYDE1Q6ZW31 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SYDE1Q6ZW31 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SYDE1Q6ZW31 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SYDE1Q6ZW31 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SYDE1Q6ZW31 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SYDE1Q6ZW31 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.8 ms