Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUF6

LINC00336, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00336, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00336Q6ZUF6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LINC00336Q6ZUF6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00336Q6ZUF6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00336Q6ZUF6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00336Q6ZUF6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00336Q6ZUF6 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00336Q6ZUF6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LINC00336Q6ZUF6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
LINC00336Q6ZUF6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
LINC00336Q6ZUF6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
LINC00336Q6ZUF6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms