Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZST2

ZCCHC23, Zinc finger CCHC domain-containing protein 23, humanhuman

Predictions only

Length 131 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZCCHC23Q6ZST2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZCCHC23Q6ZST2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZCCHC23Q6ZST2 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZCCHC23Q6ZST2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZCCHC23Q6ZST2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
ZCCHC23Q6ZST2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC23Q6ZST2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC23Q6ZST2 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZCCHC23Q6ZST2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms