Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRT6

PRR23B, Proline-rich protein 23B, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRR23BQ6ZRT6 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PRR23BQ6ZRT6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
PRR23BQ6ZRT6 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PRR23BQ6ZRT6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRR23BQ6ZRT6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRR23BQ6ZRT6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PRR23BQ6ZRT6 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
PRR23BQ6ZRT6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PRR23BQ6ZRT6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRR23BQ6ZRT6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRR23BQ6ZRT6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PRR23BQ6ZRT6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRR23BQ6ZRT6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRR23BQ6ZRT6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PRR23BQ6ZRT6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
PRR23BQ6ZRT6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PRR23BQ6ZRT6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PRR23BQ6ZRT6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR23BQ6ZRT6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR23BQ6ZRT6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PRR23BQ6ZRT6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms