Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZRR5

TMEM136, Transmembrane protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM136Q6ZRR5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
TMEM136Q6ZRR5 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
TMEM136Q6ZRR5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TMEM136Q6ZRR5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 CDV3-203ENST00000431519 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
TMEM136Q6ZRR5 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1374.7 ms