Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ93

Usp34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, mousemouse

Predictions only

Length 3,582 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp34Q6ZQ93 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp34Q6ZQ93 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp34Q6ZQ93 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp34Q6ZQ93 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp34Q6ZQ93 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Usp34Q6ZQ93 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp34Q6ZQ93 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp34Q6ZQ93 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp34Q6ZQ93 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp34Q6ZQ93 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp34Q6ZQ93 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp34Q6ZQ93 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp34Q6ZQ93 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp34Q6ZQ93 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp34Q6ZQ93 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Usp34Q6ZQ93 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Usp34Q6ZQ93 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp34Q6ZQ93 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp34Q6ZQ93 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp34Q6ZQ93 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp34Q6ZQ93 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp34Q6ZQ93 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Usp34Q6ZQ93 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp34Q6ZQ93 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp34Q6ZQ93 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp34Q6ZQ93 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp34Q6ZQ93 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp34Q6ZQ93 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp34Q6ZQ93 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp34Q6ZQ93 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp34Q6ZQ93 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp34Q6ZQ93 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp34Q6ZQ93 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp34Q6ZQ93 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Usp34Q6ZQ93 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms