Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ12

Ninl, Ninein-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinlQ6ZQ12 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NinlQ6ZQ12 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
NinlQ6ZQ12 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
NinlQ6ZQ12 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC32.76■■■□□ 2.83
NinlQ6ZQ12 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NinlQ6ZQ12 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
NinlQ6ZQ12 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
NinlQ6ZQ12 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
NinlQ6ZQ12 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
NinlQ6ZQ12 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
NinlQ6ZQ12 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC32.72■■■□□ 2.83
NinlQ6ZQ12 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NinlQ6ZQ12 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
NinlQ6ZQ12 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
NinlQ6ZQ12 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NinlQ6ZQ12 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
NinlQ6ZQ12 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
NinlQ6ZQ12 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC32.7■■■□□ 2.82
NinlQ6ZQ12 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
NinlQ6ZQ12 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
NinlQ6ZQ12 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NinlQ6ZQ12 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
NinlQ6ZQ12 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NinlQ6ZQ12 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
NinlQ6ZQ12 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
NinlQ6ZQ12 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
NinlQ6ZQ12 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
NinlQ6ZQ12 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
NinlQ6ZQ12 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC32.65■■■□□ 2.82
NinlQ6ZQ12 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC32.64■■■□□ 2.82
NinlQ6ZQ12 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NinlQ6ZQ12 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
NinlQ6ZQ12 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NinlQ6ZQ12 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
NinlQ6ZQ12 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NinlQ6ZQ12 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NinlQ6ZQ12 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
NinlQ6ZQ12 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
NinlQ6ZQ12 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
NinlQ6ZQ12 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NinlQ6ZQ12 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
NinlQ6ZQ12 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
NinlQ6ZQ12 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.57■■■□□ 2.8
NinlQ6ZQ12 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
NinlQ6ZQ12 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
NinlQ6ZQ12 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
NinlQ6ZQ12 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
NinlQ6ZQ12 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
NinlQ6ZQ12 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
NinlQ6ZQ12 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
NinlQ6ZQ12 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
NinlQ6ZQ12 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
NinlQ6ZQ12 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
NinlQ6ZQ12 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
NinlQ6ZQ12 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
NinlQ6ZQ12 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
NinlQ6ZQ12 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NinlQ6ZQ12 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.45■■■□□ 2.79
NinlQ6ZQ12 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
NinlQ6ZQ12 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
NinlQ6ZQ12 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
NinlQ6ZQ12 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NinlQ6ZQ12 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NinlQ6ZQ12 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NinlQ6ZQ12 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
NinlQ6ZQ12 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
NinlQ6ZQ12 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NinlQ6ZQ12 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
NinlQ6ZQ12 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
NinlQ6ZQ12 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
NinlQ6ZQ12 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
NinlQ6ZQ12 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
NinlQ6ZQ12 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
NinlQ6ZQ12 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
NinlQ6ZQ12 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
NinlQ6ZQ12 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
NinlQ6ZQ12 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NinlQ6ZQ12 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
NinlQ6ZQ12 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
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