Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPY2

Smg5, Protein SMG5, mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg5Q6ZPY2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Smg5Q6ZPY2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smg5Q6ZPY2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Smg5Q6ZPY2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg5Q6ZPY2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg5Q6ZPY2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Smg5Q6ZPY2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Smg5Q6ZPY2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg5Q6ZPY2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg5Q6ZPY2 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Smg5Q6ZPY2 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg5Q6ZPY2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Smg5Q6ZPY2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg5Q6ZPY2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg5Q6ZPY2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Smg5Q6ZPY2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg5Q6ZPY2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Smg5Q6ZPY2 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Smg5Q6ZPY2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Smg5Q6ZPY2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg5Q6ZPY2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Smg5Q6ZPY2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg5Q6ZPY2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg5Q6ZPY2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg5Q6ZPY2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg5Q6ZPY2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Smg5Q6ZPY2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Smg5Q6ZPY2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg5Q6ZPY2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Smg5Q6ZPY2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Smg5Q6ZPY2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg5Q6ZPY2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Smg5Q6ZPY2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smg5Q6ZPY2 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smg5Q6ZPY2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Smg5Q6ZPY2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Smg5Q6ZPY2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms