Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
C16orf54Q6UWD8 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
C16orf54Q6UWD8 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
C16orf54Q6UWD8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
C16orf54Q6UWD8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms