Protein–RNA interactions for Protein: Q6RFH8

DUX4L9, Double homeobox protein 4C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L9Q6RFH8 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
DUX4L9Q6RFH8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DUX4L9Q6RFH8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
DUX4L9Q6RFH8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.3■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
DUX4L9Q6RFH8 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms