Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Tcaf3Q6QR59 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Tcaf3Q6QR59 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Tcaf3Q6QR59 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Tcaf3Q6QR59 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tcaf3Q6QR59 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Tcaf3Q6QR59 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Tcaf3Q6QR59 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Tcaf3Q6QR59 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tcaf3Q6QR59 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Tcaf3Q6QR59 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Tcaf3Q6QR59 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Tcaf3Q6QR59 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tcaf3Q6QR59 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tcaf3Q6QR59 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Tcaf3Q6QR59 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tcaf3Q6QR59 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tcaf3Q6QR59 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tcaf3Q6QR59 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Tcaf3Q6QR59 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Tcaf3Q6QR59 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tcaf3Q6QR59 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tcaf3Q6QR59 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Tcaf3Q6QR59 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tcaf3Q6QR59 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Tcaf3Q6QR59 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Tcaf3Q6QR59 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcaf3Q6QR59 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcaf3Q6QR59 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcaf3Q6QR59 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Tcaf3Q6QR59 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
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