Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI98

INO80C, INO80 complex subunit C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80CQ6PI98 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
INO80CQ6PI98 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
INO80CQ6PI98 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
INO80CQ6PI98 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
INO80CQ6PI98 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
INO80CQ6PI98 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
INO80CQ6PI98 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
INO80CQ6PI98 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
INO80CQ6PI98 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
INO80CQ6PI98 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
INO80CQ6PI98 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
INO80CQ6PI98 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms