Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHR2

ULK3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ULK3Q6PHR2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ULK3Q6PHR2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ULK3Q6PHR2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ULK3Q6PHR2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ULK3Q6PHR2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ULK3Q6PHR2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.5 ms