Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG16

Hjurp, Holliday junction recognition protein, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HjurpQ6PG16 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HjurpQ6PG16 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HjurpQ6PG16 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HjurpQ6PG16 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HjurpQ6PG16 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HjurpQ6PG16 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HjurpQ6PG16 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HjurpQ6PG16 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
HjurpQ6PG16 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
HjurpQ6PG16 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
HjurpQ6PG16 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HjurpQ6PG16 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HjurpQ6PG16 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HjurpQ6PG16 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
HjurpQ6PG16 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
HjurpQ6PG16 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
HjurpQ6PG16 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
HjurpQ6PG16 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HjurpQ6PG16 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HjurpQ6PG16 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HjurpQ6PG16 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HjurpQ6PG16 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HjurpQ6PG16 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms