Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFY8

Trim45, Tripartite motif-containing protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim45Q6PFY8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim45Q6PFY8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim45Q6PFY8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Trim45Q6PFY8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Trim45Q6PFY8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms