Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Nup98Q6PFD9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nup98Q6PFD9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Nup98Q6PFD9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Nup98Q6PFD9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Nup98Q6PFD9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Nup98Q6PFD9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Nup98Q6PFD9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Nup98Q6PFD9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Nup98Q6PFD9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nup98Q6PFD9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Nup98Q6PFD9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nup98Q6PFD9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
Nup98Q6PFD9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Nup98Q6PFD9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Nup98Q6PFD9 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nup98Q6PFD9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nup98Q6PFD9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Nup98Q6PFD9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nup98Q6PFD9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Nup98Q6PFD9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Nup98Q6PFD9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nup98Q6PFD9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nup98Q6PFD9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Nup98Q6PFD9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup98Q6PFD9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup98Q6PFD9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Nup98Q6PFD9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Nup98Q6PFD9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup98Q6PFD9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup98Q6PFD9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nup98Q6PFD9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup98Q6PFD9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup98Q6PFD9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup98Q6PFD9 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup98Q6PFD9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nup98Q6PFD9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup98Q6PFD9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup98Q6PFD9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Nup98Q6PFD9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nup98Q6PFD9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup98Q6PFD9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nup98Q6PFD9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup98Q6PFD9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup98Q6PFD9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
Nup98Q6PFD9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nup98Q6PFD9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nup98Q6PFD9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Nup98Q6PFD9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup98Q6PFD9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup98Q6PFD9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup98Q6PFD9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nup98Q6PFD9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup98Q6PFD9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Nup98Q6PFD9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Nup98Q6PFD9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Nup98Q6PFD9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 116.7 ms