Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4E1

CASC4, Protein CASC4, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASC4Q6P4E1 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
CASC4Q6P4E1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CASC4Q6P4E1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CASC4Q6P4E1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CASC4Q6P4E1 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CASC4Q6P4E1 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms