Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1N0

CC2D1A, Coiled-coil and C2 domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 951 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CC2D1AQ6P1N0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CC2D1AQ6P1N0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CC2D1AQ6P1N0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1AQ6P1N0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1AQ6P1N0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CC2D1AQ6P1N0 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CC2D1AQ6P1N0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CC2D1AQ6P1N0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.7■■■□□ 2.03
CC2D1AQ6P1N0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CC2D1AQ6P1N0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CC2D1AQ6P1N0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CC2D1AQ6P1N0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
CC2D1AQ6P1N0 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D1AQ6P1N0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D1AQ6P1N0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
CC2D1AQ6P1N0 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CC2D1AQ6P1N0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms