Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1E7

Primpol, DNA-directed primase/polymerase protein, mousemouse

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrimpolQ6P1E7 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PrimpolQ6P1E7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PrimpolQ6P1E7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PrimpolQ6P1E7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PrimpolQ6P1E7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PrimpolQ6P1E7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PrimpolQ6P1E7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PrimpolQ6P1E7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PrimpolQ6P1E7 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PrimpolQ6P1E7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PrimpolQ6P1E7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
PrimpolQ6P1E7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PrimpolQ6P1E7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PrimpolQ6P1E7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PrimpolQ6P1E7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
PrimpolQ6P1E7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PrimpolQ6P1E7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PrimpolQ6P1E7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
PrimpolQ6P1E7 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PrimpolQ6P1E7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PrimpolQ6P1E7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PrimpolQ6P1E7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
PrimpolQ6P1E7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PrimpolQ6P1E7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PrimpolQ6P1E7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PrimpolQ6P1E7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PrimpolQ6P1E7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PrimpolQ6P1E7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
PrimpolQ6P1E7 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PrimpolQ6P1E7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PrimpolQ6P1E7 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PrimpolQ6P1E7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PrimpolQ6P1E7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PrimpolQ6P1E7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PrimpolQ6P1E7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PrimpolQ6P1E7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PrimpolQ6P1E7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PrimpolQ6P1E7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PrimpolQ6P1E7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PrimpolQ6P1E7 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PrimpolQ6P1E7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PrimpolQ6P1E7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PrimpolQ6P1E7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
PrimpolQ6P1E7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PrimpolQ6P1E7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms