Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZR5

Skiv2l, Superkiller viralicidic activity 2-like (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skiv2lQ6NZR5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Skiv2lQ6NZR5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Skiv2lQ6NZR5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Skiv2lQ6NZR5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Skiv2lQ6NZR5 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Skiv2lQ6NZR5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Skiv2lQ6NZR5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Skiv2lQ6NZR5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Skiv2lQ6NZR5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Skiv2lQ6NZR5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Skiv2lQ6NZR5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Skiv2lQ6NZR5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Skiv2lQ6NZR5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Skiv2lQ6NZR5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Skiv2lQ6NZR5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Skiv2lQ6NZR5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Skiv2lQ6NZR5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Skiv2lQ6NZR5 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Skiv2lQ6NZR5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Skiv2lQ6NZR5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Skiv2lQ6NZR5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Skiv2lQ6NZR5 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Skiv2lQ6NZR5 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Skiv2lQ6NZR5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Skiv2lQ6NZR5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Skiv2lQ6NZR5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Skiv2lQ6NZR5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Skiv2lQ6NZR5 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Skiv2lQ6NZR5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Skiv2lQ6NZR5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Skiv2lQ6NZR5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Skiv2lQ6NZR5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Skiv2lQ6NZR5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Skiv2lQ6NZR5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Skiv2lQ6NZR5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Skiv2lQ6NZR5 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Skiv2lQ6NZR5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Skiv2lQ6NZR5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Skiv2lQ6NZR5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Skiv2lQ6NZR5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Skiv2lQ6NZR5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skiv2lQ6NZR5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Skiv2lQ6NZR5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skiv2lQ6NZR5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skiv2lQ6NZR5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Skiv2lQ6NZR5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Skiv2lQ6NZR5 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Skiv2lQ6NZR5 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Skiv2lQ6NZR5 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skiv2lQ6NZR5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skiv2lQ6NZR5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Skiv2lQ6NZR5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skiv2lQ6NZR5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skiv2lQ6NZR5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skiv2lQ6NZR5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Skiv2lQ6NZR5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skiv2lQ6NZR5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skiv2lQ6NZR5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Skiv2lQ6NZR5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skiv2lQ6NZR5 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skiv2lQ6NZR5 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skiv2lQ6NZR5 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skiv2lQ6NZR5 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skiv2lQ6NZR5 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Skiv2lQ6NZR5 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Skiv2lQ6NZR5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Skiv2lQ6NZR5 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Skiv2lQ6NZR5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Skiv2lQ6NZR5 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Skiv2lQ6NZR5 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Skiv2lQ6NZR5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skiv2lQ6NZR5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skiv2lQ6NZR5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skiv2lQ6NZR5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Skiv2lQ6NZR5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Skiv2lQ6NZR5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skiv2lQ6NZR5 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skiv2lQ6NZR5 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skiv2lQ6NZR5 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Skiv2lQ6NZR5 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms