Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXZ1

Krba1, Protein KRBA1, mousemouse

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krba1Q6NXZ1 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Krba1Q6NXZ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Krba1Q6NXZ1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Krba1Q6NXZ1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krba1Q6NXZ1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Krba1Q6NXZ1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Krba1Q6NXZ1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Krba1Q6NXZ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krba1Q6NXZ1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Krba1Q6NXZ1 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krba1Q6NXZ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krba1Q6NXZ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krba1Q6NXZ1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Krba1Q6NXZ1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krba1Q6NXZ1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krba1Q6NXZ1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Krba1Q6NXZ1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Krba1Q6NXZ1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Krba1Q6NXZ1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Krba1Q6NXZ1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Krba1Q6NXZ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krba1Q6NXZ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Krba1Q6NXZ1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krba1Q6NXZ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krba1Q6NXZ1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Krba1Q6NXZ1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Krba1Q6NXZ1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Krba1Q6NXZ1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Krba1Q6NXZ1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krba1Q6NXZ1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krba1Q6NXZ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krba1Q6NXZ1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krba1Q6NXZ1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Krba1Q6NXZ1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Krba1Q6NXZ1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Krba1Q6NXZ1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Krba1Q6NXZ1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms