Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
H3F3CQ6NXT2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
H3F3CQ6NXT2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3F3CQ6NXT2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3F3CQ6NXT2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
H3F3CQ6NXT2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3F3CQ6NXT2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3F3CQ6NXT2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3F3CQ6NXT2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
H3F3CQ6NXT2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
H3F3CQ6NXT2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3F3CQ6NXT2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
H3F3CQ6NXT2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
H3F3CQ6NXT2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
H3F3CQ6NXT2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
H3F3CQ6NXT2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
H3F3CQ6NXT2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms