Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Fndc3bQ6NWW9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Fndc3bQ6NWW9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Fndc3bQ6NWW9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fndc3bQ6NWW9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fndc3bQ6NWW9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Fndc3bQ6NWW9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Fndc3bQ6NWW9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fndc3bQ6NWW9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Fndc3bQ6NWW9 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Fndc3bQ6NWW9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Fndc3bQ6NWW9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Fndc3bQ6NWW9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Fndc3bQ6NWW9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fndc3bQ6NWW9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fndc3bQ6NWW9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Fndc3bQ6NWW9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fndc3bQ6NWW9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Fndc3bQ6NWW9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Fndc3bQ6NWW9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fndc3bQ6NWW9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Fndc3bQ6NWW9 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Fndc3bQ6NWW9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Fndc3bQ6NWW9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Fndc3bQ6NWW9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fndc3bQ6NWW9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fndc3bQ6NWW9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Fndc3bQ6NWW9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Fndc3bQ6NWW9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc3bQ6NWW9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc3bQ6NWW9 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc3bQ6NWW9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc3bQ6NWW9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Fndc3bQ6NWW9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fndc3bQ6NWW9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Fndc3bQ6NWW9 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Fndc3bQ6NWW9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Fndc3bQ6NWW9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fndc3bQ6NWW9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Fndc3bQ6NWW9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fndc3bQ6NWW9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Fndc3bQ6NWW9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Fndc3bQ6NWW9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc3bQ6NWW9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc3bQ6NWW9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Fndc3bQ6NWW9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc3bQ6NWW9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc3bQ6NWW9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc3bQ6NWW9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Fndc3bQ6NWW9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fndc3bQ6NWW9 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fndc3bQ6NWW9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Fndc3bQ6NWW9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc3bQ6NWW9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc3bQ6NWW9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc3bQ6NWW9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Fndc3bQ6NWW9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Fndc3bQ6NWW9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fndc3bQ6NWW9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Fndc3bQ6NWW9 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fndc3bQ6NWW9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Fndc3bQ6NWW9 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Fndc3bQ6NWW9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Fndc3bQ6NWW9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fndc3bQ6NWW9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Fndc3bQ6NWW9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fndc3bQ6NWW9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fndc3bQ6NWW9 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Fndc3bQ6NWW9 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Fndc3bQ6NWW9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fndc3bQ6NWW9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Fndc3bQ6NWW9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc3bQ6NWW9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc3bQ6NWW9 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc3bQ6NWW9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc3bQ6NWW9 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Fndc3bQ6NWW9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms