Protein–RNA interactions for Protein: Q6MZZ7

CAPN13, Calpain-13, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN13Q6MZZ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CAPN13Q6MZZ7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CAPN13Q6MZZ7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.77■■□□□ 1.56
CAPN13Q6MZZ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CAPN13Q6MZZ7 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80 ms