Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
CENPPQ6IPU0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CENPPQ6IPU0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CENPPQ6IPU0 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CENPPQ6IPU0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms