Protein–RNA interactions for Protein: Q6GMV2

SMYD5, SET and MYND domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD5Q6GMV2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
SMYD5Q6GMV2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SMYD5Q6GMV2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMYD5Q6GMV2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMYD5Q6GMV2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.8 ms