Protein–RNA interactions for Protein: Q6FHJ7

SFRP4, Secreted frizzled-related protein 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4Q6FHJ7 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SFRP4Q6FHJ7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SFRP4Q6FHJ7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP4Q6FHJ7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
SFRP4Q6FHJ7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFRP4Q6FHJ7 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFRP4Q6FHJ7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SFRP4Q6FHJ7 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFRP4Q6FHJ7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFRP4Q6FHJ7 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFRP4Q6FHJ7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFRP4Q6FHJ7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFRP4Q6FHJ7 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SFRP4Q6FHJ7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SFRP4Q6FHJ7 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP4Q6FHJ7 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP4Q6FHJ7 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP4Q6FHJ7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SFRP4Q6FHJ7 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
SFRP4Q6FHJ7 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
SFRP4Q6FHJ7 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55 ms