Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW0

Guanine nucleotide exchange C9orf72 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6DFW0 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Q6DFW0 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q6DFW0 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q6DFW0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q6DFW0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Q6DFW0 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Q6DFW0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q6DFW0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Q6DFW0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Q6DFW0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q6DFW0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q6DFW0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q6DFW0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Q6DFW0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Q6DFW0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q6DFW0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q6DFW0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q6DFW0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q6DFW0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Q6DFW0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Q6DFW0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q6DFW0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Q6DFW0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.6 ms