Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp7Q6A4J8 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp7Q6A4J8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Usp7Q6A4J8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp7Q6A4J8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp7Q6A4J8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Usp7Q6A4J8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp7Q6A4J8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Usp7Q6A4J8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp7Q6A4J8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp7Q6A4J8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp7Q6A4J8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Usp7Q6A4J8 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp7Q6A4J8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Usp7Q6A4J8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Usp7Q6A4J8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Usp7Q6A4J8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Usp7Q6A4J8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Usp7Q6A4J8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Usp7Q6A4J8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Usp7Q6A4J8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.2 ms