Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZZ6

Tmcc1, Transmembrane and coiled-coil domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmcc1Q69ZZ6 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Tmcc1Q69ZZ6 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tmcc1Q69ZZ6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tmcc1Q69ZZ6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tmcc1Q69ZZ6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmcc1Q69ZZ6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tmcc1Q69ZZ6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmcc1Q69ZZ6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmcc1Q69ZZ6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tmcc1Q69ZZ6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmcc1Q69ZZ6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmcc1Q69ZZ6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmcc1Q69ZZ6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tmcc1Q69ZZ6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.9 ms