Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS0

Pdzrn3, E3 ubiquitin-protein ligase PDZRN3, mousemouse

Predictions only

Length 1,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzrn3Q69ZS0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pdzrn3Q69ZS0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pdzrn3Q69ZS0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pdzrn3Q69ZS0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Pdzrn3Q69ZS0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdzrn3Q69ZS0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pdzrn3Q69ZS0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdzrn3Q69ZS0 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pdzrn3Q69ZS0 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdzrn3Q69ZS0 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdzrn3Q69ZS0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdzrn3Q69ZS0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pdzrn3Q69ZS0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pdzrn3Q69ZS0 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Pdzrn3Q69ZS0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pdzrn3Q69ZS0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pdzrn3Q69ZS0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Pdzrn3Q69ZS0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pdzrn3Q69ZS0 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Pdzrn3Q69ZS0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pdzrn3Q69ZS0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Pdzrn3Q69ZS0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pdzrn3Q69ZS0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Pdzrn3Q69ZS0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Pdzrn3Q69ZS0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pdzrn3Q69ZS0 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pdzrn3Q69ZS0 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Pdzrn3Q69ZS0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pdzrn3Q69ZS0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
Pdzrn3Q69ZS0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdzrn3Q69ZS0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pdzrn3Q69ZS0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdzrn3Q69ZS0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Pdzrn3Q69ZS0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pdzrn3Q69ZS0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdzrn3Q69ZS0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdzrn3Q69ZS0 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pdzrn3Q69ZS0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pdzrn3Q69ZS0 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pdzrn3Q69ZS0 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Pdzrn3Q69ZS0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pdzrn3Q69ZS0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pdzrn3Q69ZS0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pdzrn3Q69ZS0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pdzrn3Q69ZS0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdzrn3Q69ZS0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pdzrn3Q69ZS0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdzrn3Q69ZS0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdzrn3Q69ZS0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdzrn3Q69ZS0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pdzrn3Q69ZS0 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdzrn3Q69ZS0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pdzrn3Q69ZS0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Pdzrn3Q69ZS0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Pdzrn3Q69ZS0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.8 ms