Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZB0

Lrrcc1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrcc1Q69ZB0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Lrrcc1Q69ZB0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Lrrcc1Q69ZB0 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrcc1Q69ZB0 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Lrrcc1Q69ZB0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Lrrcc1Q69ZB0 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrcc1Q69ZB0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrcc1Q69ZB0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Lrrcc1Q69ZB0 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Lrrcc1Q69ZB0 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Lrrcc1Q69ZB0 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Lrrcc1Q69ZB0 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Lrrcc1Q69ZB0 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Lrrcc1Q69ZB0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Lrrcc1Q69ZB0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Lrrcc1Q69ZB0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.9 ms