Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn2Q68FG2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn2Q68FG2 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sptbn2Q68FG2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sptbn2Q68FG2 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sptbn2Q68FG2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sptbn2Q68FG2 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Sptbn2Q68FG2 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sptbn2Q68FG2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sptbn2Q68FG2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sptbn2Q68FG2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sptbn2Q68FG2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sptbn2Q68FG2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sptbn2Q68FG2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sptbn2Q68FG2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn2Q68FG2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn2Q68FG2 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn2Q68FG2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn2Q68FG2 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sptbn2Q68FG2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn2Q68FG2 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn2Q68FG2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn2Q68FG2 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sptbn2Q68FG2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn2Q68FG2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn2Q68FG2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sptbn2Q68FG2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sptbn2Q68FG2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sptbn2Q68FG2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Sptbn2Q68FG2 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Sptbn2Q68FG2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Sptbn2Q68FG2 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms