Protein–RNA interactions for Protein: Q68E01

INTS3, Integrator complex subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,043 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INTS3Q68E01 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC32.6■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC32.59■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC32.59■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
INTS3Q68E01 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
INTS3Q68E01 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
INTS3Q68E01 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC32.55■■■□□ 2.8
INTS3Q68E01 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
INTS3Q68E01 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
INTS3Q68E01 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
INTS3Q68E01 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
INTS3Q68E01 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
INTS3Q68E01 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
INTS3Q68E01 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
INTS3Q68E01 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
INTS3Q68E01 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.5■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC32.49■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
INTS3Q68E01 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.44■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC32.43■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.41■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
INTS3Q68E01 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
INTS3Q68E01 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
INTS3Q68E01 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
INTS3Q68E01 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
INTS3Q68E01 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.37■■■□□ 2.77
INTS3Q68E01 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
INTS3Q68E01 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
INTS3Q68E01 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
INTS3Q68E01 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
INTS3Q68E01 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
INTS3Q68E01 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
INTS3Q68E01 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
INTS3Q68E01 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
INTS3Q68E01 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
INTS3Q68E01 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC32.27■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms