Protein–RNA interactions for Protein: Q674R7

ATG9B, Autophagy-related protein 9B, humanhuman

Predictions only

Length 924 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG9BQ674R7 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
ATG9BQ674R7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
ATG9BQ674R7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
ATG9BQ674R7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ATG9BQ674R7 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.5 ms