Protein–RNA interactions for Protein: Q64455

Ptprj, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, mousemouse

Predictions only

Length 1,238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprjQ64455 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PtprjQ64455 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprjQ64455 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprjQ64455 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PtprjQ64455 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PtprjQ64455 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprjQ64455 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprjQ64455 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprjQ64455 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
PtprjQ64455 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprjQ64455 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprjQ64455 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
PtprjQ64455 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprjQ64455 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PtprjQ64455 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
PtprjQ64455 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PtprjQ64455 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprjQ64455 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprjQ64455 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprjQ64455 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PtprjQ64455 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PtprjQ64455 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PtprjQ64455 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PtprjQ64455 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprjQ64455 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprjQ64455 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PtprjQ64455 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprjQ64455 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PtprjQ64455 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
PtprjQ64455 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprjQ64455 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprjQ64455 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprjQ64455 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprjQ64455 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprjQ64455 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprjQ64455 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
PtprjQ64455 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprjQ64455 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PtprjQ64455 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprjQ64455 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprjQ64455 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprjQ64455 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PtprjQ64455 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 343.8 ms