Protein–RNA interactions for Protein: Q62461

Gm20854, (clone BALB10N), mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20854Q62461 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Gm20854Q62461 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Gm20854Q62461 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm20854Q62461 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Gm20854Q62461 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Gm20854Q62461 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.8 ms