Protein–RNA interactions for Protein: Q62424

Hoxa13, Homeobox protein Hox-A13, mousemouse

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Length 386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa13Q62424 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxa13Q62424 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Hoxa13Q62424 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Hoxa13Q62424 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxa13Q62424 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Hoxa13Q62424 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Hoxa13Q62424 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Hoxa13Q62424 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Hoxa13Q62424 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxa13Q62424 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxa13Q62424 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxa13Q62424 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxa13Q62424 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Hoxa13Q62424 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Hoxa13Q62424 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxa13Q62424 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxa13Q62424 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Hoxa13Q62424 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxa13Q62424 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Hoxa13Q62424 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxa13Q62424 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Hoxa13Q62424 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxa13Q62424 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Hoxa13Q62424 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxa13Q62424 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxa13Q62424 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxa13Q62424 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Hoxa13Q62424 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Hoxa13Q62424 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Hoxa13Q62424 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxa13Q62424 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Hoxa13Q62424 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxa13Q62424 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxa13Q62424 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Hoxa13Q62424 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa13Q62424 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa13Q62424 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Hoxa13Q62424 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Hoxa13Q62424 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Hoxa13Q62424 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Hoxa13Q62424 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Hoxa13Q62424 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxa13Q62424 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxa13Q62424 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Hoxa13Q62424 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Hoxa13Q62424 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxa13Q62424 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxa13Q62424 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxa13Q62424 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Hoxa13Q62424 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxa13Q62424 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxa13Q62424 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxa13Q62424 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Hoxa13Q62424 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Hoxa13Q62424 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Hoxa13Q62424 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Hoxa13Q62424 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Hoxa13Q62424 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxa13Q62424 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxa13Q62424 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxa13Q62424 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Hoxa13Q62424 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxa13Q62424 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxa13Q62424 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Hoxa13Q62424 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Hoxa13Q62424 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Hoxa13Q62424 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Hoxa13Q62424 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxa13Q62424 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxa13Q62424 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxa13Q62424 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxa13Q62424 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Hoxa13Q62424 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Hoxa13Q62424 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Hoxa13Q62424 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Hoxa13Q62424 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxa13Q62424 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxa13Q62424 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxa13Q62424 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxa13Q62424 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Hoxa13Q62424 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxa13Q62424 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxa13Q62424 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Hoxa13Q62424 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxa13Q62424 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxa13Q62424 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxa13Q62424 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxa13Q62424 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxa13Q62424 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Hoxa13Q62424 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Hoxa13Q62424 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
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