Protein–RNA interactions for Protein: Q61789

Lama3, Laminin subunit alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 3,330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lama3Q61789 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Lama3Q61789 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lama3Q61789 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Lama3Q61789 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Lama3Q61789 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lama3Q61789 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lama3Q61789 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lama3Q61789 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lama3Q61789 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lama3Q61789 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lama3Q61789 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lama3Q61789 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lama3Q61789 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lama3Q61789 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Lama3Q61789 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Lama3Q61789 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lama3Q61789 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lama3Q61789 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Lama3Q61789 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Lama3Q61789 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Lama3Q61789 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lama3Q61789 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Lama3Q61789 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lama3Q61789 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lama3Q61789 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lama3Q61789 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Lama3Q61789 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lama3Q61789 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lama3Q61789 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Lama3Q61789 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.72
Lama3Q61789 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
Lama3Q61789 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Lama3Q61789 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms