Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Trim25Q61510 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Trim25Q61510 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Trim25Q61510 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Trim25Q61510 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Trim25Q61510 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms