Protein–RNA interactions for Protein: Q61466

Smarcd1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily D member 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcd1Q61466 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Smarcd1Q61466 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcd1Q61466 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcd1Q61466 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcd1Q61466 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Smarcd1Q61466 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Smarcd1Q61466 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcd1Q61466 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcd1Q61466 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Smarcd1Q61466 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcd1Q61466 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Smarcd1Q61466 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcd1Q61466 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcd1Q61466 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcd1Q61466 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Smarcd1Q61466 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Smarcd1Q61466 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Smarcd1Q61466 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcd1Q61466 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Smarcd1Q61466 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcd1Q61466 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcd1Q61466 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Smarcd1Q61466 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Smarcd1Q61466 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcd1Q61466 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcd1Q61466 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcd1Q61466 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Smarcd1Q61466 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Smarcd1Q61466 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Smarcd1Q61466 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcd1Q61466 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Smarcd1Q61466 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarcd1Q61466 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Smarcd1Q61466 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Smarcd1Q61466 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Smarcd1Q61466 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Smarcd1Q61466 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Smarcd1Q61466 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Smarcd1Q61466 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcd1Q61466 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcd1Q61466 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcd1Q61466 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcd1Q61466 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcd1Q61466 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Smarcd1Q61466 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcd1Q61466 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Smarcd1Q61466 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Smarcd1Q61466 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Smarcd1Q61466 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Smarcd1Q61466 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms