Protein–RNA interactions for Protein: Q61451

Cd53, Leukocyte surface antigen CD53, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd53Q61451 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Cd53Q61451 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Cd53Q61451 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cd53Q61451 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cd53Q61451 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cd53Q61451 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd53Q61451 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd53Q61451 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd53Q61451 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd53Q61451 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd53Q61451 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd53Q61451 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cd53Q61451 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd53Q61451 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd53Q61451 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd53Q61451 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cd53Q61451 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd53Q61451 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cd53Q61451 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cd53Q61451 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cd53Q61451 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cd53Q61451 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms