Protein–RNA interactions for Protein: Q61165

Slc9a1, Sodium/hydrogen exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9a1Q61165 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Slc9a1Q61165 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Slc9a1Q61165 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc9a1Q61165 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc9a1Q61165 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Slc9a1Q61165 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc9a1Q61165 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Slc9a1Q61165 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc9a1Q61165 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Slc9a1Q61165 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc9a1Q61165 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Slc9a1Q61165 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Slc9a1Q61165 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc9a1Q61165 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Slc9a1Q61165 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc9a1Q61165 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc9a1Q61165 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Slc9a1Q61165 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc9a1Q61165 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Slc9a1Q61165 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc9a1Q61165 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Slc9a1Q61165 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc9a1Q61165 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc9a1Q61165 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc9a1Q61165 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Slc9a1Q61165 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Slc9a1Q61165 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Slc9a1Q61165 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Slc9a1Q61165 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Slc9a1Q61165 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc9a1Q61165 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc9a1Q61165 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc9a1Q61165 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Slc9a1Q61165 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc9a1Q61165 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc9a1Q61165 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Slc9a1Q61165 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Slc9a1Q61165 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Slc9a1Q61165 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc9a1Q61165 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Slc9a1Q61165 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Slc9a1Q61165 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms