Protein–RNA interactions for Protein: Q61060

Foxd3, Forkhead box protein D3, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd3Q61060 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Foxd3Q61060 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd3Q61060 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Foxd3Q61060 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd3Q61060 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd3Q61060 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Foxd3Q61060 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd3Q61060 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd3Q61060 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd3Q61060 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd3Q61060 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Foxd3Q61060 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxd3Q61060 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxd3Q61060 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Foxd3Q61060 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Foxd3Q61060 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxd3Q61060 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Foxd3Q61060 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd3Q61060 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd3Q61060 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Foxd3Q61060 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Foxd3Q61060 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd3Q61060 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Foxd3Q61060 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd3Q61060 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd3Q61060 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Foxd3Q61060 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd3Q61060 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd3Q61060 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd3Q61060 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Foxd3Q61060 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd3Q61060 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Foxd3Q61060 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Foxd3Q61060 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Foxd3Q61060 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd3Q61060 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd3Q61060 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Foxd3Q61060 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Foxd3Q61060 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Foxd3Q61060 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd3Q61060 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd3Q61060 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Foxd3Q61060 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxd3Q61060 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Foxd3Q61060 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Foxd3Q61060 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms