Protein–RNA interactions for Protein: Q61043

Nin, Ninein, mousemouse

Predictions only

Length 2,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NinQ61043 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
NinQ61043 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NinQ61043 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NinQ61043 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
NinQ61043 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NinQ61043 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
NinQ61043 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
NinQ61043 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
NinQ61043 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
NinQ61043 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NinQ61043 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
NinQ61043 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NinQ61043 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NinQ61043 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
NinQ61043 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
NinQ61043 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NinQ61043 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
NinQ61043 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NinQ61043 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
NinQ61043 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NinQ61043 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
NinQ61043 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NinQ61043 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
NinQ61043 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
NinQ61043 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NinQ61043 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NinQ61043 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NinQ61043 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NinQ61043 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NinQ61043 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NinQ61043 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
NinQ61043 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
NinQ61043 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NinQ61043 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NinQ61043 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.3■■■□□ 2.12
NinQ61043 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
NinQ61043 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
NinQ61043 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
NinQ61043 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NinQ61043 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NinQ61043 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
NinQ61043 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NinQ61043 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
NinQ61043 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.12
NinQ61043 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
NinQ61043 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
NinQ61043 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NinQ61043 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NinQ61043 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
NinQ61043 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NinQ61043 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NinQ61043 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NinQ61043 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
NinQ61043 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NinQ61043 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NinQ61043 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
NinQ61043 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
NinQ61043 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
NinQ61043 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NinQ61043 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NinQ61043 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
NinQ61043 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
NinQ61043 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NinQ61043 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NinQ61043 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
NinQ61043 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
NinQ61043 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
NinQ61043 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NinQ61043 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NinQ61043 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
NinQ61043 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NinQ61043 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
NinQ61043 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
NinQ61043 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NinQ61043 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NinQ61043 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
NinQ61043 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NinQ61043 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
NinQ61043 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NinQ61043 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NinQ61043 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NinQ61043 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NinQ61043 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC28.14■■■□□ 2.09
NinQ61043 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.09
NinQ61043 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NinQ61043 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NinQ61043 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NinQ61043 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NinQ61043 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
NinQ61043 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NinQ61043 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
NinQ61043 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
NinQ61043 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
NinQ61043 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NinQ61043 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NinQ61043 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
NinQ61043 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NinQ61043 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
NinQ61043 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
NinQ61043 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms