Protein–RNA interactions for Protein: Q61025

Ift20, Intraflagellar transport protein 20 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift20Q61025 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ift20Q61025 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Ift20Q61025 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ift20Q61025 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ift20Q61025 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ift20Q61025 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms