Protein–RNA interactions for Protein: Q60961

Laptm4a, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Laptm4aQ60961 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Laptm4aQ60961 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Laptm4aQ60961 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Laptm4aQ60961 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Laptm4aQ60961 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Laptm4aQ60961 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Laptm4aQ60961 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Laptm4aQ60961 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Laptm4aQ60961 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Laptm4aQ60961 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Laptm4aQ60961 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Laptm4aQ60961 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Laptm4aQ60961 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Laptm4aQ60961 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Laptm4aQ60961 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Laptm4aQ60961 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Laptm4aQ60961 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms